Las cuevas en si consiste en un sistema de varias cámaras menos espaciosas que a la entrada. A pesar de todo entre las piezas rotas que se encuentran fue posible encontrar varias estalactitas y mineralizaciones caprichosas que aun muestran crecimiento. Estas llevan cientos de años que aumenten su tamaño por milímetros, y tocar dichas formaciones, las contamina y detiene la acumulación de minerales.
La cueva se encuentra a menos de 5 kilómetros desde la Trinidad, una vez ahí se comenzara el descenso del mismo. Es recomendable no hacer ruidos, ya sea hablar en vos alta, gritar, ni llevar música y mucho menos golpear las rocas o los muros rocosos, ya que hay abejas en el lugar. Así mismo el utilizar perfumes.
Para llegar la Cueva del Rayo, se debe tomar desde la ciudad de Guatemala, la carretera interamericana, dejando en el paso a Xela, la cabecera de Huehuetenango, finalmente llegar hasta la Finca Trinidad.